INRA-Versailles Arabidopsis natural variants

Dernière version Publié par Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) le Aug 27, 2014 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)

The Versailles Arabidopsis Stock Center provides seeds useful to the international research community. It is based in Versailles (France), at the Jean-Pierre Bourgin Institute (IJPB) of the National Institute for Agricultural Research (INRA). Seed stocks available for distribution include: 54915 T-DNA insertion lines corresponding to 46236 Flanking Sequence Tags (FST) more than 600 natural accessions (ecotypes) 132 F2 mapping populations 16 Recombinant Inbred Line (RIL) populations 3 nearly-isogenic line sets (HIF: Heterogeneous Inbred Family) a panel of epigenetic recombinant inbred lines (epiRIL)

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 777 enregistrements.

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées des ressources sont disponibles au téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Téléchargements

Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :

Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 777 enregistrements dans Anglais (23 KB) - Fréquence de mise à jour: inconnue
Métadonnées sous forme de fichier EML télécharger dans Anglais (7 KB)
Métadonnées sous forme de fichier RTF télécharger dans Anglais (7 KB)

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

The seeds were provided by the Versailles Arabidopsis Stock Center (http://publiclines.versailles.inra.fr/)

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). This [DATA(BASE)] is made available under the Public Domain Dedication and License v1.0 whose full text can be found at: http://www.opendatacommons.org/licenses/pddl/1.0/.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 3bad05e1-2fe0-469e-9560-45e7d1d1b70c.  Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF France.

Mots-clé

Occurrence; genetic resources; Arabidopsis

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Autres personnes associées à la ressource:

Utilisateur
Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Couverture géographique

World

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Species  Arabidopsis thaliana

Citations bibliographiques

  1. Samson F et al. (2002) FLAGdb/FST : a database for mapped flanking insertion sites (FSTs) of Arabidopsis thaliana T-DNA transformants. Nucleic Acids Res. 30 (1):94-7.
  2. McKhann H I, Camilleri C, Bérard A, Bataillon T, David J L, Reboud X, Le Corre V, Caloustian C, Gut I G, Brunel D.(2004). Nested core collections maximizing genetic diversity in Arabidopsis thaliana. Plant J 38 : 193-202.
  3. Simon M, Simon A, Martins F, Botran L, Tisné S, Granier F, Loudet O and Camilleri C (2012). DNA fingerprinting and new tools for fine-scale discrimination of Arabidopsis thaliana accessions. The Plant Journal 69: 1094-1101.
  4. Simon, M., Loudet, O., Durand, S., Bérard, A., Brunel, D., Sennesal, F-X, Durand-Tardif, M., Pelletier, G. and Camilleri, C. (2008). QTL mapping in five new large RIL populations of Arabidopsis thaliana genotyped with consensus SNP markers. Genetics 178: 2253-2264.
  5. Johannes F., Porcher E., Teixeira F., Saliba-Colombani V., Simon M., Agier N., Bulski A., Albuisson J., Heredia F. Audigier P., Bouchez D., Dillmann C., Guerche P., Hospital F., Colot V.(2009). Assessing the impact of transgenerational epigenetic variation on complex traits. PLoS Genet 5(6): e1000530.

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs http://www.gbif.fr/ipt/resource.do?r=inra_arabidopsis