INRA-Versailles Arabidopsis natural variants

Versão mais recente publicado por Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) em Aug 27, 2014 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)

The Versailles Arabidopsis Stock Center provides seeds useful to the international research community. It is based in Versailles (France), at the Jean-Pierre Bourgin Institute (IJPB) of the National Institute for Agricultural Research (INRA). Seed stocks available for distribution include: 54915 T-DNA insertion lines corresponding to 46236 Flanking Sequence Tags (FST) more than 600 natural accessions (ecotypes) 132 F2 mapping populations 16 Recombinant Inbred Line (RIL) populations 3 nearly-isogenic line sets (HIF: Heterogeneous Inbred Family) a panel of epigenetic recombinant inbred lines (epiRIL)

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 777 registros.

Este IPT armazena os dados e, portanto, serve como um repositório de dados. Os dados e os metadados do recurso estão disponíveis para download no seção de downloads. A tabela de versões lista outras versões do recurso que foram disponibilizadas ao público e permite o rastreamento das alterações realizadas no recurso ao longo do tempo.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 777 registros em English (23 KB) - Frequência de atualização: desconhecido
Metadados como um arquivo EML download em English (7 KB)
Metadados como um arquivo RTF download em English (7 KB)

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

The seeds were provided by the Versailles Arabidopsis Stock Center (http://publiclines.versailles.inra.fr/)

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). This [DATA(BASE)] is made available under the Public Domain Dedication and License v1.0 whose full text can be found at: http://www.opendatacommons.org/licenses/pddl/1.0/.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 3bad05e1-2fe0-469e-9560-45e7d1d1b70c.  Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF France.

Palavras-chave

Occurrence; genetic resources; Arabidopsis

Contatos

Quem criou esse recurso:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Quem preencher os metadados:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Quem mais foi associado com o recurso:

Usuário
Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Cobertura Geográfica

World

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-90, -180], Norte Leste [90, 180]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Espécie  Arabidopsis thaliana

Citações bibliográficas

  1. Samson F et al. (2002) FLAGdb/FST : a database for mapped flanking insertion sites (FSTs) of Arabidopsis thaliana T-DNA transformants. Nucleic Acids Res. 30 (1):94-7.
  2. McKhann H I, Camilleri C, Bérard A, Bataillon T, David J L, Reboud X, Le Corre V, Caloustian C, Gut I G, Brunel D.(2004). Nested core collections maximizing genetic diversity in Arabidopsis thaliana. Plant J 38 : 193-202.
  3. Simon M, Simon A, Martins F, Botran L, Tisné S, Granier F, Loudet O and Camilleri C (2012). DNA fingerprinting and new tools for fine-scale discrimination of Arabidopsis thaliana accessions. The Plant Journal 69: 1094-1101.
  4. Simon, M., Loudet, O., Durand, S., Bérard, A., Brunel, D., Sennesal, F-X, Durand-Tardif, M., Pelletier, G. and Camilleri, C. (2008). QTL mapping in five new large RIL populations of Arabidopsis thaliana genotyped with consensus SNP markers. Genetics 178: 2253-2264.
  5. Johannes F., Porcher E., Teixeira F., Saliba-Colombani V., Simon M., Agier N., Bulski A., Albuisson J., Heredia F. Audigier P., Bouchez D., Dillmann C., Guerche P., Hospital F., Colot V.(2009). Assessing the impact of transgenerational epigenetic variation on complex traits. PLoS Genet 5(6): e1000530.

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos http://www.gbif.fr/ipt/resource.do?r=inra_arabidopsis