INRA-Versailles Arabidopsis natural variants

Последняя версия опубликована Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) Aug 27, 2014 Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

The Versailles Arabidopsis Stock Center provides seeds useful to the international research community. It is based in Versailles (France), at the Jean-Pierre Bourgin Institute (IJPB) of the National Institute for Agricultural Research (INRA). Seed stocks available for distribution include: 54915 T-DNA insertion lines corresponding to 46236 Flanking Sequence Tags (FST) more than 600 natural accessions (ecotypes) 132 F2 mapping populations 16 Recombinant Inbred Line (RIL) populations 3 nearly-isogenic line sets (HIF: Heterogeneous Inbred Family) a panel of epigenetic recombinant inbred lines (epiRIL)

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 777 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем (репозиторием) данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. Перечень версий служит для отображения истории публикации версий данного ресурса.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 777 Записи в English (23 KB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (7 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (7 KB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

The seeds were provided by the Versailles Arabidopsis Stock Center (http://publiclines.versailles.inra.fr/)

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). This [DATA(BASE)] is made available under the Public Domain Dedication and License v1.0 whose full text can be found at: http://www.opendatacommons.org/licenses/pddl/1.0/.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 3bad05e1-2fe0-469e-9560-45e7d1d1b70c.  Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF France.

Ключевые слова

Occurrence; genetic resources; Arabidopsis

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Кем заполнены метаданные:

Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Кто еще связан с данным ресурсом:

User
Christine Camilleri
Responsable scientifique
INRA Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech 78000 Versailles FR 33130833316
http://www-ijpb.versailles.inra.fr/en/plateformes/cra/index.html

Географический охват

World

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Species  Arabidopsis thaliana

Библиографические ссылки

  1. Samson F et al. (2002) FLAGdb/FST : a database for mapped flanking insertion sites (FSTs) of Arabidopsis thaliana T-DNA transformants. Nucleic Acids Res. 30 (1):94-7.
  2. McKhann H I, Camilleri C, Bérard A, Bataillon T, David J L, Reboud X, Le Corre V, Caloustian C, Gut I G, Brunel D.(2004). Nested core collections maximizing genetic diversity in Arabidopsis thaliana. Plant J 38 : 193-202.
  3. Simon M, Simon A, Martins F, Botran L, Tisné S, Granier F, Loudet O and Camilleri C (2012). DNA fingerprinting and new tools for fine-scale discrimination of Arabidopsis thaliana accessions. The Plant Journal 69: 1094-1101.
  4. Simon, M., Loudet, O., Durand, S., Bérard, A., Brunel, D., Sennesal, F-X, Durand-Tardif, M., Pelletier, G. and Camilleri, C. (2008). QTL mapping in five new large RIL populations of Arabidopsis thaliana genotyped with consensus SNP markers. Genetics 178: 2253-2264.
  5. Johannes F., Porcher E., Teixeira F., Saliba-Colombani V., Simon M., Agier N., Bulski A., Albuisson J., Heredia F. Audigier P., Bouchez D., Dillmann C., Guerche P., Hospital F., Colot V.(2009). Assessing the impact of transgenerational epigenetic variation on complex traits. PLoS Genet 5(6): e1000530.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы http://www.gbif.fr/ipt/resource.do?r=inra_arabidopsis