Occurrence

Abundances and biological traits of trout (salmo trutta) and salmon (salmo salar) sampled by electrofishing (except specific abundance indices) from 1985 to 2005 on the Nivelle (France).

Dernière version Publié par Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) le 16 mars 2022 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)
From 1988 to 2005, an annual campaign was conducted to quantify by electrofishing the abundance of fishes in the Nivelle basin. It was usually done in September and October. The data consists of 1228 electrofishing operations and 22035 fish records (trout and salmon). Biological traits measured on the fish sampled are sex, maturity status, length, weight and age. Scale sampling is carried out on a subsample of individuals to estimate the age of the fish. The survey is carried out under the Research Observatory on Diadromous Fish in Coastal Streams (ERO DiaPFC) program. The data are stored in the database of the ERO. They are used to develop predictive models and tools for providing scientific advice to improve the management of these heritage species

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 22 035 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

  • Occurrence (noyau)
    22035
  • MeasurementOrFacts 
    176280

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

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Versions

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Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 80cfd007-9093-4122-97cd-4ef9f3253983.  Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF France.

Mots-clé

Population density; population distribution; catch effort; salmo salar; salmon; Occurrence

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Frédéric Lange
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, L'institut Agro, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Aquapôle - Ibarron
64310 St-Pée-sur-Nivelle
FR
+33559515975
Didier Azam
Researcher
INRAE, Pole OFB-INRAE-L'institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, U3E, F-35042, Rennes, France.
INRAE-U3E, 65 rue de St Brieuc
35042 Rennes
FR
+33 223485786
Etienne Prévost
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, L'institut Agro, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Aquapôle - Ibarron
64310 St-Pée-sur-Nivelle
FR
+33559515983
Jacques Rives
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, L'institut Agro, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Aquapôle - Ibarron
64310 St-Pée-sur-Nivelle
FR
+33559515984
Jacques Dumas
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, L'institut Agro, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
FR
Lionel Barrière
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, L'institut Agro, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Aquapôle - Ibarron
64310 St-Pée-sur-Nivelle
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Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Frédéric Marchand
Researcher
INRAE, Pole OFB-INRAE-L'institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, U3E, F-35042, Rennes, France.
INRAE-U3E, 65 rue de St Brieuc
35042 Rennes
FR
+33 223485786

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Frédéric Marchand
Researcher
INRAE, Pole OFB-INRAE-L'institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, U3E, F-35042, Rennes, France.
INRAE-U3E, 65 rue de St Brieuc
35042 Rennes
FR
+33 223485786

Autres personnes associées à la ressource:

Programmeur
Nadine Herrad
Programmer
INRAE, Pole OFB-INRAE-L'institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement, U3E, F-35042, Rennes, France.
65 rue de St Brieuc, CS 84215
35042 Rennes
FR
+33 223485773
Distributeur
GBIF France
IT support
GBIF France
MNHN Géologie CP48, 43 rue Buffon
Paris
FR
+33140798065
http://www.gbif.fr

Couverture géographique

The Nivelle river in Basque Country (France). http://services.sandre.eaufrance.fr/Courdo/Fiche/client/fiche_courdo.php?CdSandre=S52-0400

Enveloppe géographique Sud Ouest [43,253, -1,67], Nord Est [43,391, -1,467]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Species  Salmo trutta (Truite, Trout),  Salmo salar (Saumon, Salmon)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1985-09-15 / 2005-10-03

Données sur le projet

The Research Observatory on Diadromous Fish in Coastal Streams (ORE DiaPFC) is a research infrastructure steered by INRAE in partnership with OFB and part of the OFB-INRAE R&D center. It’s focused on the study of the evolution of diadromous fish populations under the influence human induced environmental changes that affect these rivers (mainly climate and effects of agriculture). Diadromous species of primary interest are salmon (Salmo salar), trout (Salmo trutta), eel (Anguilla Anguilla), shads (Alosa sp.), and lampreys (Lampetra sp. and Petromyzon marinus). These species are threatened by the consequences of human activities. They are flagship species for the biodiversity of coastal streams. Nowadays, these streams are the main refuges for diadromous fish that have disappeared or dramatically declined on larger rivers. This ERO DiaPFC is a Research Infrastructure based on four coastal streams of the Atlantic and Channel coast of France: the Bresle and the Oir in Normandy, the Scorff in Brittany and the Nivelle in the Pays Basque. These four rivers are equipped with diadromous fish trapping facilities and are thoroughly and continuously surveyed from the mid 1980s. They are twinned with experimental ecology facilities located in Rennes (Brittany) and Saint-Pée-sur-Nivelle (Pays Basque). This set of facilities is complemented by individual-based eco-genetic simulators for in silico experimentation on virtual populations.

Titre ORE-DiaPFC Observatoire de Recherche en Environnement des poissons diadromes sur les Petits Fleuves Côtiers - ERO DiaPFC Ecological Research Observatory on Diadromous Fish in coastal streams
Financement - INRAE : French National Institute for Agricultural, Food en Environment Research - OFB : French Office for Biodiversity.
Description du domaine d'étude / de recherche ERO DiaPFC is a Research Infrastructure based on four coastal streams of the Atlantic and Channel coast of France: the Bresle and the Bresle and Oir in Normandy, the Scorff in Brittany and the Nivelle in the Pays Basque

Les personnes impliquées dans le projet:

Personne de Contact
Etienne Prévost

Données de collection

Nom de la collection Colisa - Collection of Ichtyological Samples
Identifiant de collection https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/D3ODJM
Méthode de conservation des spécimens Dried, 
FreeMarker template error (HTML_DEBUG mode; use RETHROW in production!)

The following has evaluated to null or missing:
==> preservationMethods[item]  [in template "WEB-INF/pages/portal/resource_new.ftl" at line 948, column 59]

----
Tip: It's the final [] step that caused this error, not those before it.
----
Tip: If the failing expression is known to legally refer to something that's sometimes null or missing, either specify a default value like myOptionalVar!myDefault, or use <#if myOptionalVar??>when-present<#else>when-missing</#if>. (These only cover the last step of the expression; to cover the whole expression, use parenthesis: (myOptionalVar.foo)!myDefault, (myOptionalVar.foo)??
----

----
FTL stack trace ("~" means nesting-related):
	- Failed at: ${preservationMethods[item]?cap_first...  [in template "WEB-INF/pages/portal/resource_new.ftl" at line 948, column 57]
----

Java stack trace (for programmers):
----
freemarker.core.InvalidReferenceException: [... Exception message was already printed; see it above ...]
	at freemarker.core.InvalidReferenceException.getInstance(InvalidReferenceException.java:134)
	at freemarker.core.EvalUtil.coerceModelToTextualCommon(EvalUtil.java:481)
	at freemarker.core.EvalUtil.coerceModelToStringOrUnsupportedMarkup(EvalUtil.java:434)
	at freemarker.core.Expression.evalAndCoerceToStringOrUnsupportedMarkup(Expression.java:139)
	at freemarker.core.BuiltInForString.getTargetString(BuiltInForString.java:34)
	at freemarker.core.BuiltInForString._eval(BuiltInForString.java:29)
	at freemarker.core.Expression.eval(Expression.java:101)
	at freemarker.core.DefaultToExpression._eval(DefaultToExpression.java:96)
	at freemarker.core.Expression.eval(Expression.java:101)
	at freemarker.core.BuiltInForLegacyEscaping._eval(BuiltInForLegacyEscaping.java:33)
	at freemarker.core.Expression.eval(Expression.java:101)
	at freemarker.core.DollarVariable.calculateInterpolatedStringOrMarkup(DollarVariable.java:100)
	at freemarker.core.DollarVariable.accept(DollarVariable.java:63)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:383)
	at freemarker.core.IteratorBlock$IterationContext.executedNestedContentForCollOrSeqListing(IteratorBlock.java:291)
	at freemarker.core.IteratorBlock$IterationContext.executeNestedContent(IteratorBlock.java:271)
	at freemarker.core.IteratorBlock$IterationContext.accept(IteratorBlock.java:244)
	at freemarker.core.Environment.visitIteratorBlock(Environment.java:657)
	at freemarker.core.IteratorBlock.acceptWithResult(IteratorBlock.java:108)
	at freemarker.core.IteratorBlock.accept(IteratorBlock.java:94)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:347)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:353)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:353)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:353)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:353)
	at freemarker.core.Environment.visit(Environment.java:353)
	at freemarker.core.Environment.process(Environment.java:326)
	at freemarker.template.Template.process(Template.java:383)
	at org.apache.struts2.views.freemarker.FreemarkerResult.doExecute(FreemarkerResult.java:184)
	at org.apache.struts2.result.StrutsResultSupport.execute(StrutsResultSupport.java:206)
	at com.opensymphony.xwork2.DefaultActionInvocation.executeResult(DefaultActionInvocation.java:375)
	at com.opensymphony.xwork2.DefaultActionInvocation.invoke(DefaultActionInvocation.java:279)
	at com.opensymphony.xwork2.interceptor.DefaultWorkflowInterceptor.doIntercept(DefaultWorkflowInterceptor.java:179)
	at com.opensymphony.xwork2.interceptor.MethodFilterInterceptor.intercept(MethodFilterInterceptor.java:99)
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	at com.opensymphony.xwork2.interceptor.ConversionErrorInterceptor.doIntercept(ConversionErrorInterceptor.java:142)
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	at com.opensymphony.xwork2.interceptor.ParametersInterceptor.doIntercept(ParametersInterceptor.java:140)
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	at com.opensymphony.xwork2.interceptor.ParametersInterceptor.doIntercept(ParametersInterceptor.java:140)
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	at com.opensymphony.xwork2.DefaultActionInvocation.invoke(DefaultActionInvocation.java:249)
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	at com.opensymphony.xwork2.DefaultActionInvocation.invoke(DefaultActionInvocation.java:249)
	at org.apache.struts2.factory.StrutsActionProxy.execute(StrutsActionProxy.java:48)
	at org.apache.struts2.dispatcher.Dispatcher.serviceAction(Dispatcher.java:574)
	at org.apache.struts2.dispatcher.ExecuteOperations.executeAction(ExecuteOperations.java:79)
	at org.apache.struts2.dispatcher.filter.StrutsPrepareAndExecuteFilter.doFilter(StrutsPrepareAndExecuteFilter.java:141)
	at com.google.inject.servlet.FilterChainInvocation.doFilter(FilterChainInvocation.java:82)
	at org.gbif.ipt.struts2.CorsFilter.doFilter(CorsFilter.java:37)
	at com.google.inject.servlet.FilterChainInvocation.doFilter(FilterChainInvocation.java:82)
	at com.google.inject.servlet.ManagedFilterPipeline.dispatch(ManagedFilterPipeline.java:120)
	at com.google.inject.servlet.GuiceFilter.doFilter(GuiceFilter.java:133)
	at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:193)
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	at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:197)
	at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:97)
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	at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:135)
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	at org.apache.catalina.valves.AbstractAccessLogValve.invoke(AbstractAccessLogValve.java:698)
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	at org.apache.coyote.AbstractProcessorLight.process(AbstractProcessorLight.java:65)
	at org.apache.coyote.AbstractProtocol$ConnectionHandler.process(AbstractProtocol.java:882)
	at org.apache.tomcat.util.net.NioEndpoint$SocketProcessor.doRun(NioEndpoint.java:1647)
	at org.apache.tomcat.util.net.SocketProcessorBase.run(SocketProcessorBase.java:49)
	at org.apache.tomcat.util.threads.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1191)
	at org.apache.tomcat.util.threads.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:659)
	at org.apache.tomcat.util.threads.TaskThread$WrappingRunnable.run(TaskThread.java:61)
	at java.lang.Thread.run(Thread.java:750)