The French Collection of Medicago truncatula

Последняя версия опубликована Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) Feb 24, 2014 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)

The Genetic Resources and Mediterranean Medicago Plant Breeding Laboratory INRA-Montpellier has led several surveys in order to collect natural diversity of the species complex : Medicago truncatula,Medicago littoralis and Medicago tornata. It has widened its collection by exchanging materials with international collections and possesses a huge collection originating from all the Mediterranean Basin. The feature of this collection is to offer a large level of polymorphism from the natural diversity. The collection is currently being screened for phenological traits and molecular markers. Different nested core collections* of well characterized inbred lines are available to the international scientific community. Numerous data are also available upon request. * Ronfort et al 2006, BMC Plant Biology, http://www.biomedcentral.com/1471-2229/6/28.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 2,387 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем (репозиторием) данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. Перечень версий служит для отображения истории публикации версий данного ресурса.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 2,387 Записи в English (55 KB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (9 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Prosperi JM. The French National Collection of Medicago truncatula

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). This [DATA(BASE)] is made available under the Public Domain Dedication and License v1.0 whose full text can be found at: http://www.opendatacommons.org/licenses/pddl/1.0/.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: d74a4963-4f71-45a5-82ca-1d81d1ce4321.  Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF France.

Ключевые слова

Occurrence; Genetic diversity; Genetic resource; legume; natural population

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Jean-Marie Prosperi
Curator
INRA INRA - 2 place Viala 34060 Montpellier FR +33-499612743
http://www.montpellier.inra.fr/BRC-MTR/

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Jean-Marie Prosperi
Curator
INRA INRA - 2 place Viala 34060 Montpellier FR +33-499612743
http://www.montpellier.inra.fr/BRC-MTR/

Кем заполнены метаданные:

Jean-Marie Prosperi
Curator
INRA INRA - 2 place Viala 34060 Montpellier FR +33-499612743
http://www.montpellier.inra.fr/BRC-MTR/

Географический охват

Europe and Mediterranean countries

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Genus  Medicago

Временной охват

Дата начала 1980-01-01

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название The French Collection of Medicago truncatula
Описание района исследования The Genetic Resources and Mediterranean Medicago Plant Breeding Laboratory INRA-Montpellier has led several surveys in order to collect natural diversity of the species complex : Medicago truncatula,Medicago littoralis and Medicago tornata. It has widened its collection by exchanging materials with international collections and possesses a huge collection originating from all the Mediterranean Basin. The feature of this collection is to offer a large level of polymorphism from the natural diversity. The collection is currently being screened for phenological traits and molecular markers. Different nested core collections* of well characterized inbred lines are available to the international scientific community. Numerous data are also available upon request. * Ronfort et al 2006, BMC Plant Biology, http://www.biomedcentral.com/1471-2229/6/28.

Исполнители проекта:

Author
INRA (French National Agronomic Research Institute)

Библиографические ссылки

  1. Ronfort J., Bataillon T., Santoni S., Delalande M., David J.L. and Prosperi J.M., 2006. Microsatellite diversity and broad scale geographic structure in a model legume: building a set of nested core collection for studying naturally occurring variation in Medicago truncatula. BMC Plant Biology 2006, 6:28
  2. Balfourier F., Charmet G., Prosperi J.M., Goulard M. and Monestiez P., 1998. Comparison of different spatial strategies for sampling a core collection of natural populations of fodder crops. Genetic, Selection and Evolution 30(S1), S215-S235.
  3. Baquerizo-Audiot E., Desplanque B., Prosperi J.M. and Santoni S., 2001. Characterization of microsatellite loci in the diploid legume Medicago truncatula (barrel medic). Molecular Ecology Notes 1, 1-3.
  4. Béna G., Prosperi J.M., Lejeune B. and Olivieri I., 1998. Evolution of annual species of the genus Medicago : A molecular phylogenetic approach. Molecular Phylogenetics and Evolution 9(3), 552-559.
  5. Bonnin I., Huguet T., Gherardi M., Prosperi J.M., and Olivieri I. 1996. High level of polymorphism and spatial structure in a selfing plant species, Medicago truncatula (Leguminosae), shown using RAPD markers. American Journal of Botany 83(7), 843-855.
  6. Loridon K., Burgarella C., Chantret N., Martins F., Gouzy J., Prosperi J.M., Ronfort J., 2013: Single-nucleotide polymorphism discovery and diversity in the model legume Medicago truncatula. Molecular Ecology Resources 13(1), 84-95
  7. Prosperi J.M., Auricht G.C., Génier G. and Johnson R.C., 2001. Genetic Diversity of Legumes in the Mediterranean: Medics (Medicago L.). 99-114 In 'Plant Genetic Resources of Legumes in the Mediterranean' Eds Maxted N. and Bennett S. Kluwer Academic Publishers. Netherlands.
  8. Siol M., Prosperi J.M., Bonnin I. and Ronfort J., 2008. How multilocus genotypic pattern helps to understand the history of selfing populations: a case study in Medicago truncatula. Heredity 100 (5), 517-525

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы d74a4963-4f71-45a5-82ca-1d81d1ce4321
http://www.gbif.fr:8080/ipt/resource.do?r=medicago_truncatula_inra-montpellier