Benthic Intertidal Vegetation from the Tagus Estuary and Aveiro Lagoon

Événement déchantillonnage
Dernière version Publié par Université de Nantes le mars 9, 2023 Université de Nantes
Date de publication:
9 mars 2023
Publié par:
Université de Nantes
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

The objective of this dataset is to compile 0.25 m2 quadrats and the abundance of macro-phytes covering area beneath these quadrats taken across the intertidal areas of the Tagus Es-tuary and Ria de Aveiro Coastal Lagoon over the boreal summer of 2022. The data recorded percentage cover of the seagrass (Zostera noltei (Hornemann 1832)) and macroalgae, Ulva sp., Chaetomorpha sp., Fucus vesiculosus (Linnaeus 1853) and Agarophyton vermiculophyllum (Ohmi Gurgel, J.N. Norris & Fredericq, 2018.) Quadrat photographs were taken between the 13th and 17th of June 2022. This dataset has been acquired to validate maps of the spatial dis-tribution of Zostera noltei obtained at the ecosystem scale with remote sensing images and notably Sentinel 2 with a 10 to 20 m pixel resolution. Therefore, some quadrats were spatially arranged to form a cross shape to fill a 10 m satellite pixel.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 419 enregistrements.

1 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
419
Occurrence 
2095

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Davies B F R, Figueira R, Oiry S, Sousa A, Gernez P, Barillé L (2022): Benthic Intertidal Vegetation from the Tagus Estuary and Aveiro Lagoon. v1.2. No organisation. Dataset/Samplingevent. http://ipt.gbif.pt/ipt/resource?r=bentic-vegetation-tagus-aveiro&v=1.2

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Université de Nantes. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 7b14790c-8ddf-4709-9596-c938f9d5dc11.  Université de Nantes publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF France.

Mots-clé

Samplingevent; Intertidal; Vegetation; Seagrass; Macroalgae; Portugal

Contacts

Bede Ffinian Rowe Davies
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Personne De Contact
  • Researcher
ISOMer, Nantes Université
Nantes
FR
Ana Sousa
  • Créateur
  • Researcher
University of Aveiro
  • CESAM, Department of Biology, University of Aveiro
Aveiro
PT
Rui Figueira
  • Créateur
  • Researcher
Instituto Superior de Agronomia
Lisboa
PT
Simon Oiry
  • Créateur
  • Researcher
ISOMer, Nantes Université
Nantes
FR
Pierre Gernez
  • Créateur
  • Researcher
ISOMer, Nantes Université
Nantes
FR
Laurent Barillé
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
  • Researcher
ISOMer, Nantes Université
Nantes
FR
Bede Ffinian Rowe Davies
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Personne De Contact
  • Researcher
ISOMer, Nantes Université
Nantes
FR

Couverture géographique

Atlantic Coast of Portugal. The Tagus Estuary, found on the Western Portuguese Coast, is the mouth of the longest river in the Iberian peninsula. The Estuary is protected by the Tagus Es-tuary Nature Reserve as an IUCN category IV habitat and species management area. Ria de Aveiro is a shallow coastal lagoon located on the North West coast of Portugal. The only connection to the Atlantic Ocean is through a narrow channel 1.3 km in length, 350 m wide and 20 m deep. Ria de Aveiro is a Long-Term Socio-Ecological Research (LTsER) platform (https://www.lterportugal.pt/riadeaveiro) with several important habitats, it is included in the Nature 2000 network and is classified as a Special Protection Area containing Sites of Com-munity Importance.

Enveloppe géographique Sud Ouest [36,386, -12,92], Nord Est [42,876, -6,064]

Couverture taxonomique

The seagrass tracheophyta (Zostera noltei), the macroalgae ochrophyta Fucus vesiculosus and the rhodophyta Agarophyton vermiculophyllum were ranked to species level, while the chlorophytes Ulva sp. and Chaetomorpha sp. were ranked at the genus level. Nomenclature follows WoRMs (https://www.marinespecies.org).

Class Magnoliopsida (Angiosperms/Seagrasses), Phaeophyceae (Brown Algae), Ulvophyceae (Green Algae), Florideophyceae (Red Algae)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2022-06-13 / 2022-06-17

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre Biodiversity of the Coastal Ocean: Monitoring with Earth Observation (BiCOME) | BioPradaRia - Restoration, management and conservation of biodiversity and biological re-sources associated with Ria de Aveiro seagrass ecosystems | PORBIOTA - Portuguese E-Infrastructure for Information and Research on Biodiversity
Identifiant BiCOME (FutureEO-1 BIODIVERSITY+PRECURSORS No. 4000135756/21/I-EF.) | BioPradaRia (MAR-01.04.02-FEAMP-0020) | PORBIOTA (POCI-01-0145-FEDER-022127)
Financement This research was funded by a grant by the European Space Agency (ESA), and partially funded by the projects BioPradaRia (MAR-01.04.02-FEAMP-0020) (https://biopradaria.weebly.com) (Operational Program MAR2020, EMFF-European Maritime and Fisheries Fund, European Union, Portugal2020), and PORBIOTA (PO-CI-01-0145-FEDER-022127) (FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia, supported by Operational Tematic Program for Competitiveness and Internationalization POCI (COM-PETE 2020) under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement through the European Re-gional Development Fund (FEDER).

Les personnes impliquées dans le projet:

Bede Ffinian Rowe Davies
  • Auteur
Simon Oiry
  • Auteur
Pierre Gernez
  • Auteur
Laurent Barillé
  • Auteur
Ana I Sousa
  • Auteur

Méthodes déchantillonnage

Quadrats (0.25 m2) placed on benthic intertidal vegetation were photographed and images were loaded into ImageJ software. Polygons were drawn around visible extent of vegetation types, which allowed the percentage cover of each species or genus per quadrat to be calculated.

Etendue de létude Sampling was carried out across intertidal areas during low tide.
Contrôle qualité Images were analysed consistently, with 10% of images being checked by expert commentators. The dataset was adjusted to the Darwin Core specifications (Wieczorek et al. 2012) in order to be published in the GBIF network.

Description des étapes de la méthode:

  1. Quadrat Photographed alongside taking dGPS location (Trimble Geo 7).

Citations bibliographiques

  1. Wieczorek, J.; Bloom, D.; Guralnick, R.; Blum, S.; Döring, M.; Giovanni, R.; Robertson, T. & Vieglais D. (2012) Darwin Core: An evolving community-developed biodiversity data standard. PLOS One 7: e29715. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0029715 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0029715

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 7b14790c-8ddf-4709-9596-c938f9d5dc11
https://ipt.gbif.fr/resource?r=bentic-vegetation-tagus-aveiro