FAIRTraits: an enriched, FAIR-compliant database of plant traits from Mediterranean populations of 240 species

Событие Наблюдение
Последняя версия опубликовано Centre d’Ecologie Fonctionnelle & Evolutive (CEFE) авг. 26, 2025 Centre d’Ecologie Fonctionnelle & Evolutive (CEFE)

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 189 452 Записи в English (6 MB) - Частота обновления: по мере необходимости
Метаданные в формате EML Скачать в English (39 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (12 KB)

Описание

FAIRTraits compiles and standardizes plant trait data collected over the 1997-2023 period on six sites by the same research group, ensuring that a consistent methology was followed. These data were obtained on individuals from 1,955 populations of 240 species belonging to 155 genera and 48 families (172 herbaceous and 39 woody species).

FAIRTraits contains 189,452 records for 183 quantitative traits from the different plant organs (leaves, stems, roots, and reproductive parts), which have been grouped into 10 categories: allocation ratio, architecture, chemistry, dynamics, mechanics, microbial associations, morphology, phenology, physiology and plant size. Trait values are given at the level of individual measurements.

The complete FAIRTraits database in composed of six other files. One is available at GBIF as a separate Darwin Core "Checklist" archive:

(1) FAIRTraits_Taxon, which gives further details on taxa;

The other five are available in the InDoRES repository, as .csv files. These are:

(2) FAIRTraits_MeteoSitesMonth.csv, which gives data on monthly averages of meteorological variables from the meteorological stations closest to the six sites;

(3) FAIRTraits_MeteoSitesYear.csv, which gives data on yearly averages of meteorological variables from the meteorological stations closest to the six sites;

(4) FAIRTraits_EnvironmentalPlots.csv, which gives information on georeferencing, treatments, type of soils and soil properties of plots in which environmental data were collected;

(5) FAIRTraits_DescriptionEnvVariables.csv, which gives a description of variables, methods and items found in files FAIRTraits_MeteoSitesMonth.csv, FAIRTraits_MeteoSitesYear.csv and FAIRTraits_EnvironmentalPlots.csv

(6) FAIRTraits_PublishedPapers.csv, which gives a list of scientific articles in which subsets of the database have been used.

A data paper submitted to the "Ecology" journal describes the database in detail.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 189 452 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
189452
MeasurementScore 
189452
MeasurementTrait 
189452

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Garnier, E., Delalandre, L., Segrestin, J., Barkaoui, K., Kazakou, E., Navas, M.-L., Vile, D., Violle, C., Bellmann, A., Bernard-Verdier, M., Birouste, M., Blanchard, A., Bumb, I., Cruz, P., Debain, S., Fayolle, A., Fortunel, C., Grigulis, K., Laurent, G., Lavorel, S., Lloret, F., Pérez-Ramos, I. M., Prieto, I., Richarte, J. & Roumet, C.. FAIRTraits: an environmentally, methodologically and semantically enriched database of plant traits from Mediterranean populations of 240 species. Data paper to be published in Ecology (accepted 10 July 2025).

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Centre d’Ecologie Fonctionnelle & Evolutive (CEFE). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 3772c2f3-28e4-4e25-938a-93635e6642a2.  Centre d’Ecologie Fonctionnelle & Evolutive (CEFE) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF France.

Ключевые слова

Biodiversity standards; ecosystem properties; environmental conditions; Mediterranean Biogeographic Region; leaf stem and root traits; plant functional traits; gas exchange; litter mass loss; phenology; reproductive traits; terminological resources; trait-based ecology; Observation

Географический охват

Trait data in FAIRTraits have been collected at the north-western edge of the Mediterranean Biogeographic Region, in five sites located in southern France and one site located in north-eastern Spain.

Ограничивающие координаты Юг Запад [41,304, 1,891], Север Восток [43,933, 6,587]

Таксономический охват

Data were obtained on individuals from 240 species belonging to 155 genera and 48 families of higher plants. There were 238 Angiosperm and 2 Gymnosperm species. Further details are available in the FAIRTraits_Taxon GBIF archive.

Family Ericaceae, Poaceae, Geraniaceae, Buxaceae, Polygalaceae, Brassicaceae, Rubiaceae, Lamiaceae, Gentianaceae, Smilacaceae, Cistaceae, Araliaceae, Fabaceae, Crassulaceae, Violaceae, Campanulaceae, Fagaceae, Thymelaeaceae, Boraginaceae, Caprifoliaceae, Plantaginaceae, Resedaceae, Rhamnaceae, Viburnaceae, Sapindaceae, Rosaceae, Ranunculaceae, Saxifragaceae, Aristolochiaceae, Rutaceae, Cyperaceae, Vitaceae, Arecaceae, Apiaceae, Convolvulaceae, Oleaceae, Primulaceae, Asparagaceae, Cupressaceae, Linaceae, Caryophyllaceae, Pinaceae, Asteraceae, Orobanchaceae, Euphorbiaceae, Polygonaceae, Anacardiaceae, Thesiaceae

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1997-10-21 / 2023-03-05

Данные проекта

FAIRTraits assembles plant trait data collected by the ECOPAR research group at the Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (Montpellier), during the course of 12 research projects over the 1997-2023 period. Details of the individual projects are given in the "Related Projects" section below, and are further described in the data paper associated with FAIRTraits.

Название FAIRTraits
Финансирование See below in the "Related Projects" section.
Грант проекта OpenMetaPaper

French Ministry of Higher Education and Research
AAPFNSO2019OpenMetaPaper-14026
Связанные проекты MELODY: Mediterranean Landscapes in a Changing World: Coupling Dynamics and Functional Analyses (1997-2003)

DynEcoMed: Dynamique des Ecosystèmes Méditerranéens dans un Monde Changeant (2001-2006)

INDIGO: Une Nouvelle Perspective sur les Indicateurs de Diversité Végétale : Application à l’Etude des Conséquences de la Déprise Agricole et des Valeurs d’Usage des Prairies (2002-2006)

VISTA: Vulnerability of Ecosystem Services to Land Use Change in Traditional Agricultural Landscapes (2002-2006)

GEOTRAITS: Impacts des Traits Fonctionnels des Espèces Végétales sur les Cycles Biogéochimiques (2004-2007)

DivHerbe: Structure, Diversité et Fonctionnement : des Clefs Multi-Echelles pour la Gestion des Prairies Permanentes (2006-2009)

RESPIRS: The Root Economics Spectrum and InfraRed Spectroscopy (2010-2012)

O2LA: Organismes et Organisations Localement Adaptés (2010-2015)

CASCADE: Interactions Trophiques et Fonctionnement des Ecosystèmes Terrestres : une Approche Fonctionnelle et Chimique (2013-2014)

PhenBiom: Phenology and Biomechanics of Plants in the Mediterranean (2013-2018)

COMODO: Connecter les Mondes Verts et Bruns : Ecologie Trophique des Détritivores et des Phytophages en Prairie Permanente (2015-2017)

FageAnnuals: Functional Ecology of Annual Plant Species from a Mediterranean Rangeland (2012-2023)

Исполнители проекта:

Astrid Bellmann
  • Content Provider
Alain Blanchard
  • Content Provider
Iris Bumb
  • Author
Pablo Cruz
  • Author
Sandrine Debain
  • Content Provider
Karl Grigulis
  • Author
Gérard Laurent
  • Content Provider
Jean Richarte
  • Content Provider

Дополнительные метаданные

Благодарности The 12 research projects which led to the initial collection of data compiled in FAIRTraits are listed in Table 2 of the data paper describing the database submitted to Ecology. The work to prepare the database in its published format has benefited from the most welcome and enthusiastic assistance of Sophie Parmerlon (GBIF France), Yvan le Bras and Olivier Norvez (both at the Pôle National des Données de la Biodiversité), in the context of the OpenMetaPaper project funded by the French Ministry of Higher Education and Research (FNSO project AAPFNSO2019OpenMetaPaper-14026)
Альтернативные идентификаторы 3772c2f3-28e4-4e25-938a-93635e6642a2
https://ipt.gbif.fr/resource?r=fair_traits