PPEAO - Pêches scientifiques. Peuplements de poissons des écosystèmes estuariens, lagunaires et continentaux d'Afrique de l'Ouest

Monique Simier1, Jean-Marc Ecoutin2, Luis Tito de Morais2, Sophie Pamerlon3

1 IRD, UMR MARBEC (IRD, Ifremer, Université de Montpellier, CNRS) Avenue Jean Monnet - CS 30171, 34203, Sète, France; 2 IRD, Lemar UMR 6539 , IUEM Technopôle Brest-Iroise - rue Dumont d'Urville, 29280, Plouzané, France; 3 GBIF France, 

Corresponding author(s): Monique Simier (monique.simier@ird.fr)Jean-Marc EcoutinLuis Tito de Morais (Luis.Tito-de-Morais@ird.fr)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Simier M, Ecoutin J, Tito de Morais L (2016): PPEAO - Pêches scientifiques. Peuplements de poissons des écosystèmes estuariens, lagunaires et continentaux d'Afrique de l'Ouest. v1.3. IRD - Institute of Research for Development. Dataset/Occurrence. http://ipt.gbif.fr/resource?r=ppeao-pechexp&v=1.3

Abstract

Ce jeu de données regroupe des observations provenant de la partie "Pêches expérimentales" du système d'informations PPEAO (Peuplements de poissons et Pêche artisanale des Ecosystèmes estuariens, lagunaires et continentaux d'Afrique de l'Ouest) de l'IRD. Il comprend les occurrences de 314 taxons de poissons, crustacés et mollusques, collectés lors de campagnes de pêches d'échantillonnage mises en œuvre par l'IRD dans différents écosystèmes aquatiques d'Afrique de l'Ouest entre 1979 et 2013. Différents engins de pêche ont été utilisés (senne tournante, filets maillants, nasses...). L'identification des espèces a été réalisée par des chercheurs de l’IRD ou des chercheurs partenaires formés à la systématique. La qualité de l’identification est très bonne (au niveau de l'espèce à 96%). Ce jeu de données contient 213 campagnes de pêche pour 5362 coups de pêche et 30709 occurrences (28495 occurrences de poissons et 3214 occurrences de crustacés et mollusques). Le nombre d'individus observés par occurrence d'une espèce dans un coup de pêche est toujours connu. De plus, 80% des occurrences sont géolocalisées.
This dataset gathers a set of observations coming from the "Scientific Fishing" part of the IRD's PPEAO information system. PPEAO stands for "Fish communities and artisanal fisheries of West African estuarine, lagoon and freshwater ecosystems". This dataset gathers occurences of 314 taxa of fish, crustaceans and molluscs, collected by scientific sampling surveys implemented by IRD in various aquatic ecosystems in West Africa from 1979 to 2013. Several fishing gears were used (purse seine, gill nets, fyke nets...). Taxa were identified by IRD scientists or scientific partners well trained to systematics. The quality of taxa identification is very good (at the species level in 96% of cases). This dataset corresponds to 213 fishing surveys,for 5362 fishing hauls and 30709 species occurrences (28495 fish occurrences and 3214 crustaceans and molluscs occurrences). The number of individuals by species and by haul is always available. Moreover, 80% of occurences are geolocated.

Keywords: Occurrence, Observation, Afrique de l'Ouest, Zone tropicale, Estuaire, Lagune, Lac de barrage, Poisson, Crustacé, Mollusque, Pêche Scientifique, Senne tournante, Nasse, Chalut, Filet maillant, West Africa, Tropical area, Estuary, Lagoon, Reservoir lake, Fish, Crustacean, Mollusc, Scientific fishing, Purse seine, Fyke net, Trawl, Gill net

General description

Purpose: La base de données PPEAO, dans sa partie « Pêches scientifiques » ou « Pêches expérimentales », regroupe les données recueillies lors de campagnes de pêches d’échantillonnage réalisées en Afrique de l’Ouest sous supervision de chercheurs de l’IRD ou partenaires.

Cette base de données répondait à plusieurs objectifs : (i) Rassembler et homogénéiser les données sur les peuplements de poissons et leur environnement, récoltées depuis le début des années 80 par des programmes IRD dans des zones estuariennes, lagunaires et lacustres d’Afrique de l’Ouest, (ii)Informatiser les données recueillies dans le cadre du programme de recherches de l’IRD RAP 2001-2004, puis RAP2 2005-2008,(iii) Fournir un outil convivial d’exploitation de cet ensemble de données.

The PPEAO database, concerning the "Scientific Fishing" or "Experimental Fishing" part, gathers data collected during scientific sampling surveys in West Africa under supervision of IRD scientists or scientific partners. 

This database had several aims : (i) to gather and homogenize data on fish communities and their environment, collected since the begining of the 80s by IRD research programs in estuaries, lagoon or lakes in West Africa, (ii) to computerize data collected by the IRD research programs RAP (2001-2004), and RAP2 (2005-2008), (iii) to propose a user-friendly interface for the consultation of this dataset.

Project details

Project title: Unité de Recherches RAP de l'IRD : Réponses Adaptatives des populations de poissons aux pressions de l'environnement
Personnel: Simier Monique
Funding: IRD, Institut de Recherche pour le Développement, France
Study area descriptions/descriptor: Ce projet porte sur plusieurs écosystèmes aquatiques d'Afrique de l'Ouest (estuaires, lagunes, lacs de barrage). L'unité de recherches RAP a été active de 2001 à 2008 mais le jeu de données comporte aussi une partie historique collectée depuis 1979 et se prolonge jusqu'en 2013. Les taxons observés sont majoritairement des poissons et quelques crustacés et mollusques.
This project concerns several aquatic ecosystems of West Africa (estuaries, lagoons, reservoir lakes). The RAP research unit was active between 2001 and 2008 but the dataset also includes an historical part collected since 1979 and exends to 2013. The observed taxa are mainly fish and a few crustaceans and molluscs.
Design description: Les différentes campagnes de pêches expérimentales réalisées et intégrées à la base de données PPEAO peuvent correspondre à des objectifs scientifiques variés, tels que la description du peuplement d’un milieu aquatique et de sa variabilité spatio-temporelle, la recherche d’espèces particulières, la comparaison et le calibrage d’indicateurs biologiques, le test de matériel, la démonstration de la technique de pêche ou encore des expertises. Dans le premier cas, un protocole d’échantillonnage est défini, fixant un engin de pêche et un certain nombre de stations qui seront échantillonnées régulièrement à chaque campagne.

The sampling surveys completed and embedded in PPEAO database can correspond to various scientific aims, such as describing the fish community of an aquatic ecosystem and its spatio-temporal variability, searching for particular species, comparing and calibrating biological indicators, testing new sampling devices, demonstrating fishing techniques or making expertises. In the first case, a sampling protocol is defined, with a particular fishing gear and sampling sites which are regularly sampled at each survey.

Data published through GBIF: http://ipt.gbif.fr/resource?r=ppeao-pechexp

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Les échantillonnages à l'origine de ce jeu de données visaient en premier lieu à décrire les communautés de poissons des écosystèmes étudiés. Les poissons constituent donc la majeure partie des taxons observés (278 sur 314), mais on y trouve également 18 crustacés, 17 mollusques et 1 cnidaire.

Samplings at the origin of this dataset mainly aimed at describing fish communities. Consequently, fish represent the majority of observed taxa (278 out of 314), but some crustaceans, molluscs and cnidarians are also observed (respectively 18, 17 and 1).
Taxonomic ranks
Class: Scyphozoa
Order: Decapoda, Nudibranchia
Family: Belonidae, Loliginidae, Gobiidae, Syngnathidae
Genus: Aplysia, Atherina, Blennius, Callinectes, Chrysichthys, Cymbium, Cynoglossus, Eleotris, Galathea, Liza, Murex, Pomadasys, Sepia, Sepiola, Stenorhynchus, Synodontis, Tetraodon, Torpedo, Caranx, Gerres, Mugil, Solea
Species: Ablennes hians, Acanthurus monroviae, Aetomylaeus bovinus, Albula vulpes, Alectis alexandrina, Alestes baremoze, Alestes dentex, Antennarius pardalis, Antennarius striatus, Aplocheilichthys spilauchen, Apogon imberbis, Argyrosomus regius, Arius latiscutatus, Arius parkii, Arnoglossus imperialis, Auchenoglanis occidentalis, Awaous lateristriga, Bagrus bajad, Bagrus docmak, Bathygobius soporator, Batrachoides liberiensis, Bodianus scrofa, Bolinus cornutus, Boops boops, Bostrychus africanus, Brachydeuterus auritus, Brycinus leuciscus, Brycinus longipinnis, Brycinus macrolepidotus, Brycinus nurse, Butis koilomatodon, Callinectes amnicola, Callinectes pallidus, Campogramma glaycos, Campylomormyrus tamandua, Caranx crysos, Caranx hippos, Caranx rhonchus, Caranx senegallus, Carcharhinus leucas, Carcharhinus limbatus, Carlarius heudelotii, Cephalopholis nigri, Chaetodipterus lippei, Chaetodon hoefleri, Chilomycterus reticulatus, Chilomycterus spinosus, Chloroscombrus chrysurus, Chromidotilapia guentheri, Chromis chromis, Chrysichthys auratus, Chrysichthys johnelsi, Chrysichthys maurus, Chrysichthys nigrodigitatus, Citharichthys stampflii, Citharinus citharus, Clarias anguillaris, Cymbium cymbium, Cymbium glans, Cymbium pepo, Cynoglossus monodi, Cynoglossus senegalensis, Dactylopterus volitans, Dasyatis margarita, Dasyatis margaritella, Dentex canariensis, Dicentrarchus punctatus, Dicologlossa cuneata, Diodon holocanthus, Diplodus bellottii, Diplodus sargus, Diplodus vulgaris, Distichodus brevipinnis, Distichodus rostratus, Dormitator lebretonis, Drepane africana, Echeneis naucrates, Eleotris daganensis, Eleotris senegalensis, Eleotris vittata, Elops lacerta, Elops senegalensis, Enneacampus kaupi, Enteromius macrops, Ephippion guttifer, Ephippus goreensis, Epinephelus aeneus, Epinephelus marginatus, Ethmalosa fimbriata, Eucinostomus melanopterus, Fistularia petimba, Fistularia tabacaria, Fodiator acutus, Galeoides decadactylus, Gerres nigri, Gobioides sagitta, Gobionellus occidentalis, Gymnothorax afer, Gymnura altavela, Gymnura micrura, Halobatrachus didactylus, Hemicaranx bicolor, Hemichromis bimaculatus, Hemichromis fasciatus, Hemiramphus balao, Hemiramphus brasiliensis, Hepsetus odoe, Heterobranchus bidorsalis, Heterobranchus isopterus, Hippocampus algiricus, Hippopotamyrus pictus, Holthuispenaeopsis atlantica, Hydrocynus brevis, Hydrocynus forskahlii, Hyperopisus bebe, Hypleurochilus langi, Hyporhamphus picarti, Ilisha africana, Labeo coubie, Labeo parvus, Labeo senegalensis, Lagocephalus laevigatus, Lates niloticus, Lepidotrigla cadmani, Lethrinus atlanticus, Lichia amia, Lithognathus mormyrus, Liza aurata, Liza bandialensis, Liza dumerili, Liza falcipinnis, Liza grandisquamis, Lobotes surinamensis, Loligo vulgaris, Lutjanus dentatus, Lutjanus goreensis, Macrobrachium vollenhoveni, Marcusenius furcidens, Marcusenius senegalensis, Marcusenius thomasi, Marcusenius ussheri, Menippe nodifrons, Monodactylus sebae, Mormyrops anguilloides, Mormyrus macrophthalmus, Mormyrus rume, Mugil bananensis, Mugil cephalus, Mugil curema, Murex duplex, Mustelus mustelus, Mycteroperca rubra, Nematogobius maindroni, Nematopalaemon hastatus, Nicholsina usta, Octopus vulgaris, Orcynopsis unicolor, Pagellus bellottii, Pagrus auriga, Pagrus caeruleostictus, Panopeus africanus, Papyrocranus afer, Parablennius goreensis, Parailia pellucida, Parakuhlia macrophthalmus, Pegusa triophthalma, Pellonula leonensis, Penaeus kerathurus, Penaeus monodon, Penaeus notialis, Pentanemus quinquarius, Periophthalmus barbarus, Perisesarma huzardi, Petrocephalus ansorgii, Petrocephalus bane, Petrocephalus bovei, Petrocephalus soudanensis, Petrocephalus tenuicauda, Pisodonophis semicinctus, Plectorhinchus macrolepis, Plectorhinchus mediterraneus, Polydactylus quadrifilis, Polypterus endlicherii, Polypterus senegalus, Pomadasys incisus, Pomadasys jubelini, Pomadasys perotaei, Pomadasys rogerii, Pomatomus saltatrix, Porogobius schlegelii, Priacanthus arenatus, Psettodes belcheri, Pseudotolithus elongatus, Pseudotolithus epipercus, Pseudotolithus moorii, Pseudotolithus senegalensis, Pseudotolithus senegallus, Pseudotolithus typus, Pseudupeneus prayensis, Pteroscion peli, Pugilina morio, Pythonichthys macrurus, Rachycentron canadum, Raiamas senegalensis, Raja undulata, Remora remora, Rhinobatos cemiculus, Rhinobatos rhinobatos, Rhinoptera bonasus, Rhinoptera marginata, Rhizoprionodon acutus, Sanquerus validus, Sardina pilchardus, Sardinella aurita, Sardinella maderensis, Sarotherodon galilaeus, Sarotherodon melanotheron, Saurida brasiliensis, Scarus hoefleri, Schilbe intermedius, Schilbe mandibularis, Schilbe micropogon, Schilbe mystus, Sciaena umbra, Scomberomorus tritor, Scorpaena angolensis, Scorpaena maderensis, Scorpaena scrofa, Scorpaena stephanica, Selene dorsalis, Senilia senilis, Sepia bertheloti, Serranus cabrilla, Serranus scriba, Siluranodon auritus, Solea senegalensis, Solitas gruveli, Sparisoma rubripinne, Sparus aurata, Sphoeroides spengleri, Sphyraena afra, Sphyraena guachancho, Spondyliosoma cantharus, Squilla mantis, Stephanolepis hispidus, Stromateus fiatola, Strongylura senegalensis, Syacium guineensis, Symphodus bailloni, Synaptura cadenati, Synaptura lusitanica, Syngnathus pelagicus, Synodontis bastiani, Synodontis batensoda, Synodontis filamentosus, Synodontis gambiensis, Synodontis membranaceus, Synodontis ocellifer, Synodontis schall, Synodontis sorex, Tetraodon lineatus, Tilapia brevimanus, Tilapia guineensis, Tilapia mariae, Tilapia zillii, Torpedo marmorata, Torpedo torpedo, Trachinocephalus myops, Trachinotus ovatus, Trachinotus teraia, Trachurus trecae, Trichiurus lepturus, Tylochromis intermedius, Tylochromis jentinki, Tylochromis leonensis, Tylosurus crocodilus, Uca (Afruca) tangeri, Umbrina canariensis, Umbrina ronchus, Uroconger lepturus, Urogymnus ukpam, Yongeichthys thomasi, Zeus faber, Engraulis encrasicolus
Subspecies: Tylosurus acus rafale

Spatial coverage

General spatial coverage: Afrique de l'Ouest / West Africa
Les données proviennent des écosystèmes aquatiques suivants (du nord au sud):
/ Data come from the following aquatic ecosystems (from North to South):
- Parc National du Banc d'Arguin (Mauritanie)
- Delta du Sine Saloum (Sénégal)
- Estuaire de la Gambie (The Gambia)
- Lac de Manantali / Lac de Selingue (Mali)
- Archipel des Bijagos / Iles Urok, Rio Grande de Buba (Guiné-Bissau)
- Dangara / Estuaire de la Fatala (Guinée)
- Lagune Ebrié (Côte d'Ivoire)
Coordinates: 4°0'0''N and 21°0'0''N Latitude; 18°0'0''W and 2°0'0''W Longitude 

Temporal coverage: December 17, 1979 - May 15, 2013

Methods

Method step description: L’unité d’échantillonnage est le coup de pêche défini par un lieu (station), une date (campagne), un type d’engin de pêche.
Lors de chaque coup de pêche, les individus capturés (poissons, crustacés, mollusques) sont identifiés si possible au niveau de l’espèce. L’ensemble des individus pêchés lors du même coup de pêche et appartenant à la même espèce  sont dénombrés.

The sampling unit is the fish haul defined by: a site (station), a date (survey), a fishing gear.
After each fishing haul, all the captured individuals (fish, crustaceans, molluscs) are identified, if possible at the species level. All the individuals captured in the same haul and belonging to the same species are counted.
Study extent description: Ce jeu de données couvre plusieurs ecosystèmes aquatiques d'Afrique de l'Ouest : la lagune Ebrié en Côte d'Ivoire (12/1979 - 08/1982), l'estuaire du Sine Saloum au Sénégal (04/1990 - 01/1997 and 10/2001 - 10/2007), avec un focus sur l'AMP de Bamboung (03/2003 - 10/2012), l'estuaire de la Fatala et le bras de mer de Dangara en Guinée (01/1993 - 02/1994), l'archipel des Bijagos (03/1993), le Rio Grande de Buba (04/1993) et l'AMP des îles Urok (11/2011 - 05/2013) en Guinée Bissau, l'estuaire du fleuve Gambie en Gambie (11/2000 - 11/2003), le Parc National du Banc d'Arguin en Mauritanie (05/2008 - 04/2010), les lacs de barrage de Manantali et Sélingué au Mali (06/2002 - 10/2003).

This dataset covers several aquatic ecosystems of West Africa: the Ebrié lagoon in Côte d'Ivoire (12/1979 - 08/1982), the estuary of Sine Saloum in Sénégal (04/1990 - 01/1997 and 10/2001 - 10/2007), with a focus on the Bamboung MPA (03/2003 - 10/2012), the estuary of the Fatala river and the inlet of Dangara in Guinée (01/1993 - 02/1994), the Bijagos archipelago (03/1993), the Rio Grande de Buba (04/1993) and the MPA of Urok islands (11/2011 - 05/2013) in Guiné-Bissau, the estuary of the Gambia River in The Gambia (11/2000 - 11/2003), the Banc d'Arguin National Park in Mauritania (05/2008 - 04/2010), the Manantali and Selingue reservoir lakes in Mali (06/2002 - 10/2003).
Sampling description: Chaque entité géographique ayant fait l’objet d’une étude est considérée comme un système (ou écosystème). Dans chaque système sont définis un certain nombre de sites d’échantillonnage (les stations). La récolte des données se déroule sous la forme d’une ou plusieurs campagnes de pêche, mettant en œuvre un ou plusieurs engins de pêche.
L'engin de pêche utilisé le plus fréquemment(58% des occurrences) est une senne tournante coulissante de 250m de long, 18m de chute et 14mm de maille. Cet engin était déployé à l'aveugle, sans recherche de poisson, dans les stations de pêche prédéfinies. D'autres engins de pêches ont été utilisés : nasses (22.6% des occurrences) pour l'échantillonnage des juvéniles, filets maillants (12%) en Guinée, au Mali et dans l'AMP des îles Urok, chalut (5.7%) dans la partie la plus profonde de la lagune Ebrié, sennes de plage (1.6% ) dans le Sine Saloum et dans les Bijagos.

Every studied geographical entity is considered as a system (or ecosystem). In each system, a number of sampling sites (the stations) are defined. The data collection consists in several fishing surveys using one or several fishing gears.
The most frequently used fishing gear (58% of occurences) is a purse seine 250m long, 18m deep and 14mm mesh. This purse seine was used blindly, without fish searching, in the defined sampling sites. Other sampling gears were used: fyke nets (22.6% of occurrences) for juvenile fish sampling, gill nets (12%) in Guinée, Mali and the Urok islands MPA, trawl(5.7%) in the deepest area of the Ebrié lagoon and beach seines (1.6%) in the Sine Saloum the Bijagos .
Quality control description: Chaque campagne de pêche a été supervisée par un scientifique formé à la systématique des espèces présentes, ce qui a permis l'identification précise des taxons récoltés.
Every sampling survey was supervised by a scientist trained to systematics. This allowed a precise identification of the collected taxa.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive PPEAO - Pêches scientifiques. Peuplements de poissons des écosystèmes estuariens, lagunaires et continentaux d'Afrique de l'Ouest
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: http://ipt.gbif.fr/archive.do?r=ppeao-pechexp
Publication date of data: 2017-07-28
Language: French
Licences of use: Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License

Metadata language: French
Date of metadata creation: 2016-10-17
Hierarchy level: Dataset

References
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