Historical occurrences of diadromous fishes in French rivers between 1750 and 1980

Latest version published by Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) on Apr 22, 2020 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)

The dataset provides historical occurrences of diadromous fishes in French rivers between 1750 and 1980. The dataset contains 1830 observations of 8 diadromous taxa, collected from historical sources by the Fluvial Hydroecology team (HEF) (HYCAR Research Unit - INRAE - Antony) since 2007.

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Belliard J, Merg M, Beslagic S, Demougin V, Gorges G, Guilpart A, Zahm A (2020): Historical occurrences of diadromous fishes in French rivers between 1750 and 1980. v1.3. Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15454/AVHYVM

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Keywords

historical occurrence; Metropolitan France; diadromous fish; historical sources; Occurrence; Observation

Contacts

Who created the resource:

Jérôme Belliard
Researcher
Marie-Line Merg
Research Engineer
Sarah Beslagic
Vanessa Demougin
Guillaume Gorges
Alexis Guilpart
Amandine Zahm

Who can answer questions about the resource:

Jérôme Belliard
Researcher
Marie-Line Merg
Research Engineer

Who filled in the metadata:

Marie-Line Merg
Research Engineer

Geographic Coverage

The dataset covers the French metropolitan territory.

Bounding Coordinates South West [41.41, -4.922], North East [51.207, 9.668]

Taxonomic Coverage

The dataset provides historical observations for 13 diadromous fish species: allis shad (Alosa alosa), twait shad (Alosa fallax), river lamprey (Lampetra fluviatilis) and sea lamprey (Petromyzon marinus), European sturgeon (Acipenser sturio), Atlantic sturgeon (Acipenser oxyrinchus), European flounder (Platichthys flesus), houting (Coregonus oxyrinchus), smelt (Osmerus eperlanus), thinlip grey mullet (Liza ramada), thicklip grey mullet (Chelon labrosus), Atlantic salmon (Salmo salar) and sea trout (Salmo trutta).

Temporal Coverage

Start Date / End Date 1750-01-01 / 1980-12-31

Project Data

This project aimed to develop a new metric based on amphihalin fish in France. This metric is independent of the fish indicators currently used in France(IPR and IPR+) and should be used as a complementary index to assess downstream network connectivity. The first step of this project was to collect historical data. The created database gathers for each observation: the name of taxon, a date and a locality, as well as information about the data accuracy and the bibliographic source. Due to a lack of data on eel's historical distribution, we used modelled data from the IPR fish model (Oberdorff et al. (2001)) as a proxy. The data were then projected with GIS to produce historical distribution maps for each taxon. In a second step, we defined a calculation mode for the metric. The metric is a ratio between the current richness and the potential richness in migratory fish. A null score corresponds to a loss of the entire migratory community and the maximum score corresponds to a maintaining of the community. This index is calculated with presence/absence data and doesn't take into account species abundance. Consequently, a large decrease in species abundance has no impact on the index as long as the species hasn't disappeared. In the same way, a punctual occurrence of a single individual is considered as a true presence in the index. 9 taxa are included in the index calculation: the shad (grouping of Alosa alosa and Alosa fallax), the lampreys (grouping of Lampetra fluviatilis and Petromyzon marinus), the mullets (grouping of Liza ramada and Chelon labrosus), the sturgeon (Acipenser sturio), the european flounder (Platichthys flesus), the houting (Coregonus oxyrinchus), the smelt (Osmerus eperlanus), the salmonids (grouping of Salmo salar and Salmo trutta trutta) and eel (Anguilla anguilla). Two versions of the metric are available, including eels or not. The index is computed at the surface water bodies scale as defined by the Water Framework Directive. Finally, we analyzed the response of the metric to different environmental pressures. Results show that the metric is sensitive to three main factors: the downstream maximum falling height, the modification of hydrological regime at the local scale and the ratio between the sum of the falling heights of the downstream barriers and the site altitude. We concluded that the metric we developed clearly integrates breaks in continuity at the downstream network scale, which are responsible for a loss of migratory fish communities.

Title Development of metric based on diadromous fishes in France
Funding This work was supported and funded by the French Office for Biodiversity (OFB) in the frame of the "Programme 2016/2018 – Thème Etat, fonctionnement et services des écosystèmes aquatiques - Action n° 21". OFB also played an important role in the collection of current diadromous fish distribution data through electrofishing campaigns and local expertise.

The personnel involved in the project:

Author
Marie-Line Merg
Author
Jérôme Belliard

Sampling Methods

Historical observations of diadromous fish have been collected from a large range of historical sources.

Study Extent The study extent includes the French metropolitan hydrographic network which represents 430 thousand km draining 552 thousand km². The main rivers are the Loire, Seine, Garonne and Rhône rivers whose cumulative catchments represent 62% of the metropolitan territory.

Method step description:

  1. Historical source selection : Historical data on diadromous fish occurrence were collected from a large range of historical sources including different kinds of public archives related to fishery and fish stocks, old scientific and naturalist literature and more occasionally iconographic sources (old photographs and postcards). In total 165 documents were consulted.
  2. Time period selection : To characterize the historical distribution of diadromous species, we focused on the period from the mid-18th century to the beginning of the 20th century.
  3. Diadromous species selection : Initially, we planned to consider all diadromous species potentially encountered in metropolitan French rivers. However, a large amount of evidence has indicated that the past distribution of eels (Anguilla Anguilla) was very wide; and probably due to this wide distribution, historical information for this species was too spatially imprecise to establish a suitable distribution map. Notwithstanding its interest from a conservational point of view, we excluded this species from our approach. Our work focused on 13 diadromous fish species (see Taxonomic Coverage section). Due to identification uncertainties of some species in old documents (e.g. use of the common French name not enough precise to identify species), we decided to group some species under single taxon : (1) shads (including allis shad [Alosa alosa] and twait shad [Alosa fallax]); (2) diadromous lampreys (including sea lamprey [Petromyzon marinus] and river lamprey [Lampetra fluviatilis]) ; (3) diadromous salmonids (including Atlantic salmon [Salmo salar] and sea trout [Salmo trutta]) ; (4) mullets (including thinlip grey mullet [Liza ramada] and thicklip grey mullet [Chelon labrosus] and (5) sturgeons (including European sturgeon [Acipenser sturio] and Atlantic sturgeon [Acipenser oxyrinchus] (Chassaing, 2013). The species-level identification was kept for European flounder, houting and smelt, as no taxonomical confusion was possible for these species.
  4. Occurrence data georeferencing : Historical occurrences were then used for reconstructing species or taxon past distribution within the river network. For this purpose, we georeferenced all past occurrences (n = 1830). This task was made difficult by the lack of precision of some historical data. When an occurrence had not been precisely located in historical documents, we applied the following conservative approach: (1) when a species was assigned to a river within an administrative district (without more spatial precision), we georeferenced this occurrence to the most downstream section of the river in that district; (2) when the presence of a species was assigned to a river without any additional precision on its location, we georeferenced this occurrence on the downstream section of the river (in practice ca. 5 km from the confluence in the case of a tributary to a larger river and ca. 10 km from the sea for a river flowing directly into the sea).
  5. Date of species occurrence : The dating of records of fish species occurrence in historical sources was often imprecise. Given this limitation, we assigned as precise a date as possible for each occurrence of the species. This date was (1) the exact day of the observation when it was known, (2) the first day of the month when the precision was monthly, (3) the first day of the year when the precision was annual, (4) the first day of the decade when the precision was in the order of 10 years, and so on.
  6. Data precision : Since spatial and time precision varied across the observations, we added, for each record, a remark to specify the level of precision for both time and location.

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Additional Metadata

Alternative Identifiers https://doi.org/10.15454/AVHYVM
a1db3e3d-517f-4063-bf41-65bf12f6e5ab
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