Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France)

Occurrence
Dernière version Publié par MNHN - Museum national d'Histoire naturelle le mai 14, 2025 MNHN - Museum national d'Histoire naturelle
Date de publication:
14 mai 2025
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

<p>This dataset contains environmental DNA (eDNA) data collected along the estuarine gradient of the Rance Estuary (Brittany, France). It includes a list of detected Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs), their associated taxonomy, metadata, and representative DNA sequences. The data were generated using vertebrate-specific primers and aim to characterize vertebrate biodiversity and assess ecological continuity across the estuary.</p>

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 480 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
480
dnaDerivedData 
480

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Haderlé R (2025). Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France). Version 1.0. MNHN - Museum national d'Histoire naturelle. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.fr/resource?r=edna_rance_estuary&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est MNHN - Museum national d'Histoire naturelle. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource n'a pas été enregistrée sur le portail GBIF

Mots-clé

Occurrence

Contacts

Rachel Haderlé
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
  • PhD student
ISYEB
Rachel HADERLE
  • Utilisateur
Jean-Luc Jung
ISYEB
Visotheary Ung
ISYEB

Couverture géographique

The study was conducted in the Rance Estuary, located in Brittany, northwestern France. Sampling stations were distributed along the estuarine gradient, from the marine-influenced mouth near Saint-Malo to the freshwater-influenced upstream section.

Enveloppe géographique Sud Ouest [48,54, -2,03], Nord Est [48,63, -1,97]

Couverture taxonomique

,

Kingdom Animalia
Phylum Chordata
Class Aves, Mammalia, Amphibia, Actinopterygii, Actinopterygii, Actinopterygiii
Order Suliformes, Gadiformes, Anseriformes, Artiodactyla, Galliformes, Passeriformes, Pelecaniformes, Gruiformes, Carnivora, Salmoniformes, Cetacea, Centrarchiformes, Mugiliformes, Atheriniformes, Gobiiformes, Soricomorphes, Syngnathiformes, Beloniformes, Scorpaeniformes, Blenniiformes, Perciformes, Mulliformes, Anura, Esociformes, Accipitriformes, Columbiformes, Charadriiformes, Cypriniformes, Podicipediformes, Callionymiformes, Anguilliformes, Rodentia, Piciformes, Pleuronectiformes, Clupeiformes, Caudata
Family Liparidae, Gaidrosparidae, Sylviidae, Mugilidae, Columbidae, Regulidae, Anguillidae, Delphinidae, Cyclopteridae, Muridae, Picidae, Moronidae, Triglidae, Atherinidae, Scolopacidae, Talpidae, Phocoenidae, Sciuridae, Mullidae, Percidae, Scophthalmidae, Esocidae, Soricidae, Blenniidae, Bothidae, Phasianidae, Paridae, Ardeidae, Salamandridae, Salmonidae, Pleuronectidae, Anatidae, Cyprinidae, Bufonidae, Alosidae, Laridae, Corvidae, Leuciscidae, Callionymidae, Phocidae, Phalacrocoracidae, Canidae, Ammodytidae, Podicipedidae, Haematopodidae, Gobiidae, Nemacheilidae, Pholidae, Clupeidae, Phalacrocidae, Myocastoridae, Sparidae, Accipitridae, Scombridae, Labridae, Rallidae, Syngnathidae, Cervidae, Belonidae, Soleidae, Mustelidae, Centrarchidae, Cricetidae

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2023-02-03 / 2023-02-06

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France)

Les personnes impliquées dans le projet:

Rachel Haderlé
Visotheary Ung
Jean-Luc Jung

Métadonnées additionnelles