Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France)

Occurrence
Последняя версия опубликовано MNHN - Museum national d'Histoire naturelle мая 14, 2025 MNHN - Museum national d'Histoire naturelle
Дата публикации:
14 мая 2025 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 480 Записи в English (28 KB) - Частота обновления: as needed
Метаданные в формате EML Скачать в English (29 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (11 KB)

Описание

<p>This dataset contains environmental DNA (eDNA) data collected along the estuarine gradient of the Rance Estuary (Brittany, France). It includes a list of detected Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs), their associated taxonomy, metadata, and representative DNA sequences. The data were generated using vertebrate-specific primers and aim to characterize vertebrate biodiversity and assess ecological continuity across the estuary.</p>

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 480 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
480
dnaDerivedData 
480

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Haderlé R (2025). Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France). Version 1.0. MNHN - Museum national d'Histoire naturelle. Occurrence dataset. https://ipt.gbif.fr/resource?r=edna_rance_estuary&v=1.0

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является MNHN - Museum national d'Histoire naturelle. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс не был зарегистрирован в GBIF

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Rachel Haderlé
  • Originator
  • Point Of Contact
  • PhD student
Rachel HADERLE
Jean-Luc Jung
ISYEB
Visotheary Ung
ISYEB

Географический охват

The study was conducted in the Rance Estuary, located in Brittany, northwestern France. Sampling stations were distributed along the estuarine gradient, from the marine-influenced mouth near Saint-Malo to the freshwater-influenced upstream section.

Ограничивающие координаты Юг Запад [48,54, -2,03], Север Восток [48,63, -1,97]

Таксономический охват

,

Kingdom Animalia
Phylum Chordata
Class Aves, Mammalia, Amphibia, Actinopterygii, Actinopterygii, Actinopterygiii
Order Suliformes, Gadiformes, Anseriformes, Artiodactyla, Galliformes, Passeriformes, Pelecaniformes, Gruiformes, Carnivora, Salmoniformes, Cetacea, Centrarchiformes, Mugiliformes, Atheriniformes, Gobiiformes, Soricomorphes, Syngnathiformes, Beloniformes, Scorpaeniformes, Blenniiformes, Perciformes, Mulliformes, Anura, Esociformes, Accipitriformes, Columbiformes, Charadriiformes, Cypriniformes, Podicipediformes, Callionymiformes, Anguilliformes, Rodentia, Piciformes, Pleuronectiformes, Clupeiformes, Caudata
Family Liparidae, Gaidrosparidae, Sylviidae, Mugilidae, Columbidae, Regulidae, Anguillidae, Delphinidae, Cyclopteridae, Muridae, Picidae, Moronidae, Triglidae, Atherinidae, Scolopacidae, Talpidae, Phocoenidae, Sciuridae, Mullidae, Percidae, Scophthalmidae, Esocidae, Soricidae, Blenniidae, Bothidae, Phasianidae, Paridae, Ardeidae, Salamandridae, Salmonidae, Pleuronectidae, Anatidae, Cyprinidae, Bufonidae, Alosidae, Laridae, Corvidae, Leuciscidae, Callionymidae, Phocidae, Phalacrocoracidae, Canidae, Ammodytidae, Podicipedidae, Haematopodidae, Gobiidae, Nemacheilidae, Pholidae, Clupeidae, Phalacrocidae, Myocastoridae, Sparidae, Accipitridae, Scombridae, Labridae, Rallidae, Syngnathidae, Cervidae, Belonidae, Soleidae, Mustelidae, Centrarchidae, Cricetidae

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2023-02-03 / 2023-02-06

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Environmental DNA Metabarcoding for the Assessment of Vertebrate Biodiversity along the Estuarine Gradient of the Rance River (Brittany, France)

Исполнители проекта:

Rachel Haderlé
Visotheary Ung
Jean-Luc Jung

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://ipt.gbif.fr/resource?r=edna_rance_estuary