Occurrence

Colisa Biological Resource Centre - Collection of ichthyological samples

Dernière version Publié par Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) le 25 mars 2024 Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE)

Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :

Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 378 736 enregistrements dans Français (19 MB) - Fréquence de mise à jour: annuel
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Description

For many years now, within the framework of ORE DiaPFC, SOERE OLA or the OFB-INRAE-Institut Agro-UPPA Cluster, various INRAE units (U3E, UMR ECOBIOP and UMR CARRTEL) and OFB (DRAS ) take samples from many aquatic specimens. These samples, usually scales or fins, are then used by the scientific community to carry out various analyzes and research. Labeled Biological Resource Center (CRB) by the GIS IBISA, Colisa is part of the BRC4Env environment pillar of the RARE infrastructure. Our catalog references these different hard tissue samples and offers a module allowing you to perform queries on our database and select the types of data likely to interest you. You can then export this data.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 378 736 enregistrements.

6 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
378736
MeasurementOrFacts 
1514944
MaterialSample 
378736
Permit 
378736
Preparation 
378736
Preservation 
378736
ResourceRelationship 
40572

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Marchand F, Azam D, Lange F, Josset Q, Jeannot N, Goulon C, Guéraud F (2023): Fish sample collection. v1.1. GBIF France. Dataset/Occurrence. https://ipt.gbif.fr/resource?r=colisa&v=1.1

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 072fb9cc-b309-40e9-8b66-ffad4753a778.  Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF France.

Mots-clé

Occurrence;ichthyological sample;Genetic Resource

Contacts

Frédéric Marchand
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
  • Personne De Contact
Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
+33 223485786
Didier Azam
  • Créateur
Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
+33 223485786
Agnès Starck
Technician
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
FR
+33 223485786
Nicolas Jeannot
  • Créateur
Engineer
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
Rennes
FR
Chloé Goulon
  • Créateur
Researcher
INRAE USMB
75 bis avenue de Corzent
74203 THONON LES BAINS
FR
+33450267800
Valérie Hamelet
  • Créateur
Technician
INRAE USMB
75 bis avenue de Corzent
74203 THONON LES BAINS
FR
françois Guéraud
  • Créateur
Technician
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, Agrocampus-Ouest, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
FR
Frédéric Lange
  • Créateur
Technician
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, Agrocampus-Ouest, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
Françoise Daverat
  • Créateur
Researcher
Université de Pau et des Pays de l’Adour, e2s-UPPA, INRAE, OFB, Agrocampus-Ouest, ECOBIOP, Pôle pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
Aquapôle - Ibarron
St-Pée-sur-Nivelle
FR
Quentin Josset
  • Créateur
Engineer
OFB, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
92 Chaussée de Picardie
76220 Eu
Aurélie Flesselle
  • Créateur
Technician
OFB, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
92 Chaussée de Picardie
76220 Eu
FR
Agnès Starck
Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
35042 Rennes
+33 223485786
Nadine Renault
  • Programmeur
Researcher
INRAE U3E, Pôle OFB-INRAE-Agrocampus Ouest-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement
65 rue de St Brieuc, CS 84215
35042 Rennes
+33 223485773

Couverture géographique

The samples come mainly from France (metropolitan and Kerguelen Islands)

Enveloppe géographique Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180]

Couverture taxonomique

Model species, preferentially used by the scientific community to study biological mechanisms whose results can be extended to other less accessible or less documented species based on the conservation of functions and genes during evolution.

Species Salmo salar (Atlantic Salmon), Salmo trutta (Sea trout), Onchorynchus mykiss (Rainbow Trout), Cyprinus carpio (Common carp, European carp, King carp, Mirror carp), Sparus auratus (Gilthead seabream)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1958-12-18 / 2024-01-15

Méthodes d'échantillonnage

The samples come from scientific monitoring and from amateur and professional fishing.

Etendue de l'étude French metropole and Kerguelen island
Contrôle qualité The Colisa Biological Resource Centre is ISO 90001 certified

Description des étapes de la méthode:

  1. - Samples of scales or other tissues are taken from fish during fish surveys. The fish are returned to the water. Otoliths are collected from fish found dead or caught by amateur fishermen. - Age is verified from scale reading according to standard methods described by Baglinière and Le Louarn (1987) and Richard and Baglinière (1990).

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 072fb9cc-b309-40e9-8b66-ffad4753a778
https://ipt.gbif.fr/resource?r=fish_sample_collection